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网上报名很多工程公司因为资质问题不能承接部分工程，所以常有挂靠到其他有资质的公司进行工程业务。因为对外的业务处理都是以挂靠公司进行，就会造成自己公司的账务处理出现问题。从税务角度讲，税务局是不会关注你的资质问题，他关注的是你有没有按章纳税。不过因为挂靠单位最后款项要打到你公司账户，不免会引起税务局注意，查账时就会要求你们缴纳相关的税费，造成重复交税。
所以，原则上你们做分包处理，即挂靠单位承包该工程项目，你们再分包该项目，就可以解决该问题。只要做好分包的税务局备案手续，也可以避免重复交税。不过从法律意义上，有些工程项目原合同要求不可分包，将造成其他法律问题。
挂靠企业上税怎么做账?
一、当你收到工程款时(但款是要直接打到我公司的账户)要计入承包人的账户，
借：银行存款
贷：其他应付款—承包人
二、你扣了他的管理费
借：其他应付款—承包人
贷：其他业务收入
三、计算出他应交各项税费
借：其他应付款—承包人
贷：应交税金—营业税
贷：应交税金—城建税
贷：其他应交款
四、代他上交各项税费
借：应交税金—营业税
借：应交税金—城建税
借：其他应交款
贷：银行存款在其他应付款—承包人